WHO 核心神经系统肿瘤新分类强调了分子特征在肿瘤会诊及预后方面的作用。对IDH突变型星形细胞瘤的磋议泄漏，CDKN2A/B基因的纯合性缺失与不良预后有关。CDKN2A/B基因位于染色体9p农夫导航大全，编码抑癌卵白p16（INK4A）、p14（ARF）和p15（INK4B），它们齐是细胞周期的关节调控分子。2021年WHO核心神经系统肿瘤分类（WHO CNS 5）对IDH突变型星形细胞瘤的更新重心之一是，不管组织病理学分级怎样，存在CDKN2A/B纯合性缺失的肿瘤均归为WHO 4级。但是现在还莫得训诲的分子标记物折柳IDH突变的2级和3级星形细胞瘤。

近期对GLASS数据库的分子标明，CDKN2A/B杂合性缺失与IDH突变型星形细胞瘤较差的总生涯期有关。另一项基于单核苷酸多态性（SNP）的磋议中，发现非同义CDKN2A突变、CDKN2A/B杂合性缺失、PDGFRA扩增和CDK4扩增与较短的生涯期有关。但是该磋议纳入了复发的WHO 4级星形细胞瘤。由于CDKN2A/B的评估成果因所选磋议要领和部队的不同会产生权贵的互异，因此本磋议的主要野心是评估新会诊WHO 2级和3级IDH突变型星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤CDKN2A/B杂合性缺失的情况，过火与预后的影响。

磋议要领

1、组织样本与患者数据

本磋议网罗了自1994年至2022年确诊为星形细胞瘤（IDH突变，WHO 2级、3级和4级）和少突胶质细胞瘤（IDH突变，1p/19q共缺失）的组织样本。凭据WHO CNS 5，上述肿瘤被归为WHO 2级和3级肿瘤。扼杀复发肿瘤。若患者临床信息完整，则得到石蜡包埋样本。临床信息包括：东谈主口统计学、病理学会诊、CNV分析成果、IDH突变状况、ATRX突变状况、MGMT运转子甲基化、CDKN2A/B状况。

2、组织学与分子分析

对所有这个词病例的HE染色进行组织学复核。通过免疫组化法检测ATRX状况。对所有这个词患者的石蜡包埋样本进行DNA甲基化分析。基于DNA甲基化分析生成的拷贝数图谱，对每个样本的CDKN2A/B位点进行东谈主工测定，通过染色体图谱中全染色体（或大片断）缺失/增益笃定纯合性缺失或杂合性缺失。若是CDKN2A/B位点与一条染色体缺失或增益处于合并水平，或CDKN2A/B缺失的深度与合并样本单拷贝染色体缺失的深度十分，则界说为杂合性缺失。若是CDKN2A/B位点与染色体缺失或增益距离基线的距离是一条染色缺失或增益的两倍，则界说为纯合性缺失。若是跳动50%的9p染色体臂缺失，则界说为包含CDKN2A/B的杂合性片断缺失。

为了在独处的部队考据磋议成果，使用cBioPortal分析了TCGA中的两个独处部队的合并数据。仅包含存在IDH1或IDH2突变，TP53和/或ATRX突变，以及1p/19q完整的病例，且扼杀甲基化类别为“少突胶质细胞瘤，IDH突变，1p/19q非共缺失”的样本。最终得到209例患者的样本，CDKN2A/B状况的评估要领同前。

磋议成果

1、基线特征

在海德堡精神病理学磋议所数据库中，共有13.5万例患者的甲基化信息，其中有9092例会诊为IDH突变型星形细胞瘤和IDH突变，1p/19q共缺失的少突胶质细胞瘤。筛选后共有334例复核条目，其中173例星形细胞瘤，161例少突胶质细胞瘤。共纳入了42例WHO 4级的星形细胞瘤，以相通评估CDKN2A/B状况。纳入标准详见图1（略），基线特征见表1。

表1：患者的基线特征

2、WHO 2级和3级IDH突变型星形细胞瘤CDKN2A/B杂合性缺失与预后的干系农夫导航大全

在WHO 2级和3级IDH突变型星形细胞瘤中，共37例存在CDKN2A/B杂合性缺失，与野生型比拟，CDKN2A/B杂合性缺失并未导致更差的OS（p=0.2556，风险比2.29）和PFS（p=0.128，风险比1.58）。不管是2级或3级肿瘤，上述成果均无统计学互异（图2-3）。另外，Cox风险模子泄漏在WHO 2级和3级IDH突变型星形细胞瘤中，CDKN2A/B杂合性缺失不存在更权贵的死亡风险。

另外，本磋议分析了IDH突变且既往组织病理学分级为4级的星形细胞瘤。在42例肿瘤中，8例存在CDKN2A/B杂合性缺失，它们与不存在CDKN2A/B缺失的肿瘤的OS莫得权贵互异（p=0.168）。另外，存在CDKN2A/B纯合性缺失的肿瘤与不存在CDKN2A/B缺失的肿瘤比拟OS镌汰（p=0.049）。Cox风险模子泄漏，在WHO 4级肿瘤中，存在CDKN2A/B杂合性缺失的肿瘤死亡风险增多，但无统计学趣味。而CDKN2A/B纯合性缺失与死亡风险增多权贵有关。

图2：CDKN2A/B野生型和杂合性缺失型WHO 2-3级星形细胞瘤的OS（绿色：杂合性缺失型，紫色：野生型）。A：WHO 2级和3级肿瘤；B：WHO 2级肿瘤；C：WHO 3级肿瘤。

图3：CDKN2A/B野生型和杂合性缺失型WHO 2-3级星形细胞瘤的PFS（绿色：杂合性缺失型，紫色：野生型）。A：WHO 2级和3级肿瘤；B：WHO 2级肿瘤；C：WHO 3级肿瘤。

3、少突胶质细胞瘤CDKN2A/B缺失与预后的干系

在少突胶质细胞瘤中，CDKN2A/B缺失与预后的干系被合手续磋议。本磋议中，CDKN2A/B杂合性缺失患者（n=15）的OS（p=0.276）和PFS（p=0.305）与未缺失患者访佛（图4-5）。且不管WHO分级怎样，生涯成果无统计学互异。在本磋议中，莫得WHO 2级少突胶质细胞瘤存在CDKN2A/B纯合性缺失，在WHO 3级肿瘤中，仅有3例存在纯合性缺失。但这些病例的PFS较短（p=0.0257），OS有镌汰趋势（p=0.0631）。

图4：CDKN2A/B野生型和杂合性缺失型WHO 2-3级少突胶质细胞瘤的OS（绿色：杂合性缺失型，紫色：野生型）。A：WHO 2级和3级肿瘤；B：WHO 2级肿瘤；C：WHO 3级肿瘤。

图5：CDKN2A/B野生型和杂合性缺失型WHO 2-3级少突胶质细胞瘤的PFS（绿色：杂合性缺失型，紫色：野生型）。A：WHO 2级和3级肿瘤；B：WHO 2级肿瘤；C：WHO 3级肿瘤。

4、基因位点或片断缺失与预后的干系

在本磋议中，少部分CDKN2A/B杂合性缺失发扬为位点的缺失，而其他病例发扬为大片断的缺失。与不存在CDKN2A/B缺失的病例比拟，不管是位点缺失或节段性缺失，OS均无互异。但样本量较小，无法得出灵验的论断。

5、采选标准化数值评估缺失CDKN2A/B情况以及预后

将log2拷贝数比率≤-1.1界说为CDKN2A/B纯合性缺失，将-1.1＜log2拷贝数比率＜-0.4界说为杂合性缺失。凭据这种界说进行分组，导致CDKN2A/B齐全失患者数目减少，CDKN2A/B杂合性缺失数目增多。但杂合性缺失患者的OS并无镌汰。而纯合性缺失与权贵较短的OS有关。Cox风险模子也泄漏CDKN2A/B杂合性缺失患者的死亡风险无权贵增多。